幽门螺旋杆菌的治疗一般为，两种抗生素联合一种质子泵抑制剂及一种铋剂。常用的药物有阿莫西林、克拉霉素、埃索美拉唑、胶体果胶铋。在用药过程中，要明确病人有无药物使用禁忌症，有无其它的基础疾病，有无饮酒。抗生素一般在饭后口服，铋剂也要在饭后口服，而质子泵抑制剂建议在饭前口服。治疗周期一般为14天。治疗后一般建议停药至少1个月进行幽门螺旋杆菌的复查，必要时完善胃十二指肠镜的检查。