男性小便时尿道疼痛，一般考虑可能存在有泌尿道的疾病，一般多见的男性如前列腺炎或者尿道炎，都是造成男性尿道疼的原因。两种疾病临床症状表现并不同，前列腺炎主要表现为尿频、尿急、尿痛的症状；尿道炎主要表现为小便灼热、小便刺痛并且会表现出尿道分泌物增多。病人表现出上述症状以后，需要去泌尿外科经过相关的检查来判断具体的病因。可以经过前列腺彩超检查、前列腺液常规检查、尿液常规检查、尿道分泌物涂片以及支原体、衣原体等相关检测，来判断具体是哪种疾病所造成的尿道疼痛。针对不同的病因，临床治疗方法也是不一样的。