慢性胃炎主要的组织病理学特征是炎症，萎缩和肠化生。如果慢性萎缩性胃炎伴随肠化生是属于相对严重的。由于胃黏膜固有腺体被肠化生所替代，随着病情进一步发展，胃上皮或化生的肠上皮在再生过程中可能会发生发育异常，因此形成异型增生。这是属于胃癌的癌前病变，一旦形成，如果有幽门螺旋杆菌长时间感染，诱发造成胃部癌变的风险会相应增大，需要定期做胃镜及活组织检查明确。