功能性消化不良主要的症状包括上腹部灼热感，上腹部痛，餐后饱胀以及早饱，其中的一种或者多种共同存在，同时还可能合并有腹胀，嗳气，恶心呕吐，食欲不振等。有不少病人有饮食、精神因素等还会合并有失眠、焦虑、抑郁、头晕头痛等其他功能性症状，经过进一步检查排除了胃部的器质性病变。如果持续进展经过药物对症治疗不能改善者，必要时需要结合抗抑郁药物有效的促进精神症状逐渐恢复。