高位复杂性肛瘘病人约占所有肛瘘病人的5%-10%。高位复杂性肛瘘对于肛肠科医生而言为一种疑难杂症，因为高位复杂性肛瘘的位置比较高，并且牵扯的组织比较多，层次比较复杂，因此其治疗比较困难。肛瘘的根治方法为手术治疗，因此高位复杂性肛瘘的根治方法亦为手术治疗。因为每位高位复杂性肛瘘病人的瘘管走形不同，所牵扯到的组织结构不同，因此病人所选择的手术方式亦不尽相同。但是临床上有基础性的手术原则，即在保护好肛门括约肌功能的基础上进行手术治疗，防止导致括约肌的损伤，导致肛门失禁。因为高位复杂性肛瘘手术的难度比较大，因此建议病人就医的时候，尽量选正规的医疗单位进行就医，并且建议病人尽量选一些手术经验丰富，且知名度较高的专家进行手术。