子宫内膜异位症病人往往会发生比较严重的痛经。痛经的部位不光局限于是在下腹部，严重的还可以往会阴部以及肛门、大腿内侧放射。并且这种痛经会呈持续性的，逐渐加重的疼痛。这是子宫内膜异位症病人痛经比较显著的特点，病人的痛经往往是继发性的。痛经发生的原因是因为内膜异位在子宫宫腔以外，随着卵巢激素周期性的改变而发生周期性的坏死脱落，因此会刺激盆腔腹膜，因此导致疼痛的症状。