生理性的窦性心律不齐，不用处理。药物造成的窦性心律不齐，多见于洋地黄类药物、倍他受体阻滞剂、吗啡类药物等造成，在停用药物之后可以变整齐。窦性心律不齐，三岁以后儿童比较多见，常在心率慢或者睡眠中表现出。当心率增快或运动、清醒时心律可变整齐。器质性心脏病、先天性心脏病病人，也可表现出窦性心律不齐，要针对原发病进行积极的治疗，必要时给予抗心律失常的药物进行辅助治疗。