肛门直肠周围脓肿是会有后遗症。肛门直肠脓肿主要是肛管组织和肛周间隙感染所造成的化脓性疾病。如果处理不当，没有及时有效的治疗，会造成肛门扩约肌表现出损伤而造成肛门失禁，还会容易形成肛瘘。如果肛瘘进一步进展，会形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘或者膀胱瘘，这种情况就会危及肛周的脏器。所以，一旦发现肛门直肠周围脓肿，需要造成重视，必须要及时治疗，防止感染进一步蔓延造成疾病加重。经过手术切开引流、排脓、抗感染治疗，就可以治愈肛门直肠周围脓肿。