肛隐窝炎又称为肛窦炎，是肛门瓣、肛窦及肛门腺内发生的急慢性炎症性，形成的原因和感染、和损伤有关。肛窦位于直肠末端齿状线区，为肛门瓣和直肠柱之间的肠壁粘膜形成向上开口的袋状间隙。肛窦底部有肛腺导管开口，肛腺较集中于肛管的后壁成分支状，肛窦因窦底在下，开口朝上，引流比较差，容易储存粪便而引发感染和损伤。肛窦感染后可波及邻近的肛乳头，肛隐窝炎的形成有时和性激素和肛腺发育有关，人体性激素可以调节肛腺的发育，性激素的高低直接影响着肛腺的增生和萎缩，其中以雄激素的影响最大。