小孩子做肠镜的话，还是有一定的副作用的。做肠镜的话，小孩子可以在局麻的状态下来做检查的。需要注意的是，小孩子最少空腹8小时以上才可以做检查，以防不测。此外，还需要及时结合小孩子具体的临床所表现出的不良症状，再经过肠镜检查这种方式来明确具体的病变的情况，以便及时针对孩子的病因进行有效治疗。此外，还需要考虑一下孩子要进行局麻，又或者是全麻，避免孩子表现出哭闹的情况而导致意外伤害。