流行型乙型脑炎早期的症状以发热为主，大部分病人的体温比较高。发热的同时，病人可以表现出明显的头痛症状。头痛严重时，可以表现出恶心，同时伴随呕吐。病人在高热时，可以表现出明显的精神不振，有些病人可以伴随颈部强直。随着病情的进展，病人的发热症状会越来越重，病人会逐渐表现出昏迷的症状。有些病人的脑损伤比较严重，可以表现为全身性的抽搐，有些病人可以表现为强直性痉挛。如果病人表现出严重的颅内压升高或者脑干的病变，病人会表现出呼吸的不规则，甚至会表现出呼吸骤停。轻度感染的病人可以痊愈，重症病人会遗留严重的后遗症。