首先做胃镜的时候身体会表现出一些不适，此外若是经验不足的医生进行操作，可能会对胃部黏膜和咽喉表现出损伤。如果在检查的过程中，病人没有配合得当的话，可能会表现出剧烈恶心和呕吐的情况，也可能会造成喉咙黏膜表现出损伤出血。此外如果医生操作的动作很粗鲁，盲目进镜就可能会造成食管胃穿孔情况，如果穿孔病人会表现出剧烈腹痛和明显腹膜刺激症，这种情况可能需要做急诊手术。