手指脚趾关节疼痛的原因有以下这几种：第一 ，风湿或者类风湿，在风湿和类风湿疾病时会表现出四肢小关节的疼痛，同时可以伴随游走性疼痛，疼痛的时候可以伴随关节的畸形肿胀。第二，在痛风时，也会表现出脚趾和手指的多发性关节疼痛，同时可能会表现出尿酸盐的沉积，可以表现出痛风，在脚趾和手指的关节表现出无菌性的包块，可以做CT检查来确定是否是尿酸增高造成的。第三，骨性关节炎，在骨性关节炎中，只会表现出脚趾和手指的关节疼痛，同时还会表现出关节处的结节。