肛门部位起了溃疡，需要根据造成肛门部位溃疡的原因，进行个体化的治疗。如果肛门溃疡的原因，是由于肛裂后继发感染造成的，正常都需要使用高锰酸钾溶液进行坐浴，改善局部的血液循环，然后在局部涂抹莫匹罗星软膏，或者是夫西地酸软膏等药物进行抗感染的治疗。没有明显感染性病灶的情况下，可以在坐浴以后涂抹痔疮膏进行治疗。若是因为感染了疱疹病毒后，疱疹破溃而造成的溃疡，正常都是使用抗病毒的药膏治疗，比如阿昔洛韦软膏。