怀孕5个月小腹疼痛是由于生理性宫缩造成的。在怀孕12周左右孕妇就会逐渐发生生理学宫缩，一般表现为下腹紧缩，没有明显疼痛。活动后表现出，休息后缓解，属于生理现象不用处理。但是如果持续疼痛并伴随阴道出血则一定及时就诊。因为可能表现出先兆流产。此外肠道感染也可以造成小腹疼痛。建议孕妈妈定期做产检，在怀孕期间注意休息，合理饮食，适当运动，保持良好的情绪有问题及时就诊。