如果肛瘘手术后一年伤口疼痛，应该积极的前往肛肠科就诊。经过直肠指诊，触摸是否存在炎性包块，是否表现出继发感染造成脓肿的形成，还可以经过辅助检查，可以行肛周彩超明确是否存在肛周脓肿，还可以经过核磁共振检查，明确是否表现出肛瘘复发，表现出瘘管或者脓腔。如果肛瘘手术后伤口疼痛，有可能表现出局部感染，造成脓肿或者肛瘘的复发，应该积极的行手术治疗，可以行肛周脓肿切开引流术，如果复发，还应该积极的寻找内口，一次性根治手术，术后应该积极的给予中药熏洗，切口换药，还应该注意饮食调理，避免再次表现出复发。