慢性直肠炎治疗主要包括以下几个方面：1、一般治疗：包括防止感染，加强营养、注意休息；2、药物治疗：药物主要包括5-氨基水杨酸制剂，如柳氮磺吡啶、美沙拉嗪这类药物，这些药物能够明显抑制肠道炎症，减轻肠道充血、水肿。此外一个药物是糖皮质激素，主要有强的松或氢化可的松，这些药物能够抑制肠道免疫反应，减轻肠道充血、水肿，因此缓解肠道炎症。此外还有生物制剂，生物制剂是比较新型的药物，是一种免疫调节剂，免疫调节剂可以调节肠道免疫，因此抑制肠道炎症的发生。