变形杆菌食物中毒的原因是人为食用被变形杆菌污染的食品造成中毒。主要由于变形杆菌能够产生一种毒素，叫肠毒素。这种毒素对肠黏膜细胞有一定的侵袭能力，使得肠黏膜细胞病变产生炎症，表现出胃肠道一系列症状，包括腹痛、腹泻、胃肠功能紊乱等表现。变形杆菌是肠道细菌，是革兰氏阴性杆菌，对营养的要求不是太高，在多种培养基中都能够成功生长。因此，变形杆菌是一种适应于环境而易于存活，比较普遍存在的危害人类食品安全的细菌，应当造成高度的重视。