大姨妈长期都不能干净应当和子宫内膜的病变有一定的关系，很可能是表现出了功能失调性的子宫出血。一般女性在来月经以后大概7天出血就能够自己干净，如果出血的时间特别长，就会对身体导致特别大的影响，需要尽快的到医院做彩超检测来看一下子宫内膜的厚度，然后尽快的做调经治疗。如果发现子宫内膜异常的增厚，很可能是因为雌激素水平的上升导致了子宫内膜不典型性的增生，可以考虑做一个诊刮手术，手术以后进行病理检测看一下筛查的结果，然后再决定调经的治疗方案。大姨妈长期不规律有可能会对以后的卵泡发育导致一定的影响，甚至表现出排卵的障碍等。