怀孕初期有少量的褐色分泌物，这种情况有可能有两种因素造成的，一种是先兆流产，大部分怀孕的女性在妊娠早期往往会有临床表现，其中有一部分女性会表现出有下腹的隐痛，有阴道的少量出血，在经过超声确认为宫内妊娠的情况下，可以诊断为先兆流产，先兆流产的女性往往经过1-2周的休息和保胎治疗以后，大部分可以自然地缓解，症状逐渐消失，母儿的结局也是良好的，对于妊娠是没有什么不良影响的，也有一部分人会表现出有胚胎停育以及自然流产，也就是发生了流产以后，胚胎已经不能继续生长了，但是这是一少部分人。另一种可能性造成怀孕初期阴道出血的原因是宫外孕，宫外孕的患者在怀孕早期表现出月经停止下腹部疼痛，伴随阴道的少量出血，在宫外孕开始的时候，疼痛往往不剧烈，只是有下腹的隐痛，如果表现出宫外孕破裂大出血，则会造成下腹部的剧烈疼痛，伴随腹腔内出血的表现，甚至会造成失血性休克。所以怀孕初期如果有少量的褐色分泌物，还是要到医院进行相关的检查来明确诊断。