支原体感染往往病程较长，有的孩子甚至两三个星期都未能痊愈。如果没有彻底治疗，还会继续再反复发作。所以，一旦确诊为支原体感染，甚至支原体肺炎，就至少需要三到四周的疗程；如使用阿奇霉素等。如果患者病情比较重，则可以先静脉阿奇霉素或红霉素一段时间，再口服药物治疗。