肛门里面疼痛，一般来说要考虑肛周以及肛管疾病，特别是齿状线附近的疾病，因为肛门里面基本上就是齿状线的上下部位。这个位置表现出的疾病多数会造成齿状线附近的疼痛，也就是肛门里面疼痛，主要考虑到以下疾病：第一，肛窦炎，肛窦炎多数发生在频繁腹泻或者大便比较干结，排便比较困难情况下，造成了肛窦炎性感染，典型的症状就是疼痛以及瘙痒、肿胀。第二，黏膜下脓肿，是一种比较特殊的肛管直肠周围脓肿，基本上发生在齿状线以上黏膜下，会造成典型的肛门里面疼痛，特别是胀痛。第三，肛裂，特别是靠近齿状线部位的肛裂，在排便时以及排便后，会表现出肛门里面疼痛。