孕酮低一般多久会流产，主要根据孕酮低的具体数值和其他的HCG等表现来综合判断的。如果孕酮低于15纳克每毫升，提示可能有胚胎发育不良、流产的风险，但是如果及时给予补充黄体酮制剂，并且其血HCG翻倍良好的情况下，一般就有可能不会表现出流产，胚胎继续发育。但是如果孕酮低于5纳克每毫升，多提示胚胎已经停止发育。这种情况就有可能会表现出流产，甚至表现出稽留流产的可能。因此，在孕早期单纯的孕酮低，一般提示卵巢妊娠黄体功能不足或者有胚胎发育不良的可能，需要严密观察。