药物和手术治疗目前是子宫内膜异位症治疗的主要手段，根据该病的不同临床表现和病人特点，采用不同的方法，有的病人采用药物治疗，有的病人采用手术治疗，有的病人采用药物结合手术治疗。目前子宫内膜异位症药物治疗的内在机制是抑制卵巢功能，所以正常有强烈生育愿望的女性，就比较少使用药物治疗，药物还可以采用对症，比如像解热镇痛药物，像芬必得止痛，也可以配合以口服短效避孕药或者孕三烯酮来治疗，或者用Gn-RHa的治疗也是比较有效的。但是此药物治疗，一定要注意长时间使用带来的低雌激素一系列的副作用，长时间使用因为可以抑制排卵，造成月经不潮，可以产生阴道干涩、闭经、潮红，还有长时间应用会造成轻度骨质丢失或者骨痛，也可以伴随阴道分泌物或阴道少量出血，注射局部可以表现出疼痛和瘙痒，也有少数会表现出药物不良反应，像头痛、发热、瘙痒、皮疹等。孕酮是目前用的比较多的子宫内膜异位症的药物，类似孕激素的合成药物，口服孕激素治疗用于治疗子宫内膜异位症也是比较有效的。大多数病人使用孕酮后疼痛减轻或者消失，但是面临的问题是停药以后容易复发。子宫内膜异位症是慢性病，药物一般治疗确实无法根治，长时间用药可以缓解症状，但是使用药物一般不提倡超过6-12个月，用药还要考虑年龄、卵巢储备功能、不孕症持续的时间以及其它不孕因素。