脚气和灰指甲菌为真菌感染导致的，因此二者可同时进行治疗。脚气的治疗以外用药物为主，坚持用药非常重要，疗程一般需要1~2个月。对于角化过度型或者外用药物效果治疗不佳者，可以考虑系统药物治疗。治疗灰指甲的时候，如果真菌仅侵犯表浅和未累及甲根、单纯远端的甲损害，可以选择外用药物治疗。建议先用小刀或者指甲锉，尽量去除病甲，在外用30%的冰醋酸溶液或碘酊，每天两次，疗程3~6个月，直至新甲生成为止。5%的阿莫罗芬甲擦剂现阶段使用比较多，可在甲表面形成药膜，利用药物渗透甲板，疗程为2~3个月。外用药物治疗效果不佳者，可选用系统抗真菌药物进行治疗。