在寒冷的季节，婴幼儿的腹泻80%是由病毒感染造成的，而病毒性肠炎的主要病原是轮状病毒，此外还有诺如病毒、星状病毒、肠道腺病毒等等。各种病毒进入肠道以后，在小肠的上皮细胞复制，可以使细胞发生变性和坏死，受到破坏的肠黏膜上皮细胞会脱落，造成小肠黏膜的重吸收水分和电解质的能力受损，肠液在肠腔里面大量聚集而造成腹泻，同时发生病变的肠黏膜细胞，分泌双糖酶的能力不足，酶的活性也可以下降，因此使食物中的糖类不能完全被消化，这些糖类物质在肠道里被细菌分解成小分子的有机酸，使肠腔的渗透压增高，细胞里面的水分向肠道转移，进一步造成水和电解质的丢失，加重腹泻。