造成肾结石的原因，现阶段最多见可能是代谢异常，包括形成尿结石的物质排出增加。最多见的可能就是尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸排出增加。尿液的ph值改变，比如在酸性尿中容易形成尿酸和胱氨酸结晶，在碱性尿中容易形成磷酸镁胺结晶。尿液抑制晶体形成和聚集的物质减少，比如枸橼酸减少等。尿量减少，这样尿中盐类和有机物质的浓度就会增高。尿路存在局部感染、梗阻、尿路异物，都是形成结石的局部因素。长时间吃乙酰唑胺、皮质激素，也会造成结石形成。