甲硝唑对大部分厌氧菌具有抗菌作用，但对需氧菌和兼性厌氧菌无作用，抗菌谱包括脆弱拟杆菌和其他敏感菌属，梭形杆菌，产气梭状芽孢杆菌，真杆菌，消化球菌和消化链球菌等，其杀菌浓度稍高于抑菌浓度，临床主要用于预防和治疗厌氧菌造成的感染，比如呼吸道，消化道，腹腔及盆腔感染，皮肤软组织，骨和骨关节等部位的感染，以及脆弱拟杆菌造成的心内膜炎，败血症，及脑膜炎等。治疗妇科方面多见的有细菌性阴道炎，滴虫性阴道炎以及盆腔炎性疾病。