肛周囊肿主要发病部位在肛周的皮肤的表皮下，病变比较局限，和肛周脓肿不同，一般没有感染的内口。一般肛周囊肿就是在肛周表现出囊性的肿块，活动较好，没有明显的疼痛，或者肛周囊肿较大时才会表现出挤压不适的感觉。肛周囊肿一般可以采用手术剥离的方式，把整个囊肿，包括囊壁，完全清除干净，然后再缝合即可，因此治疗跟肛周脓肿也是完全不一样的。