肛门疼痛需鉴别疼痛是肌源性、神经源性还是肛周的感染性疾病，不是都可以经过药物来治疗。肛门疼痛在感染性疾病或肛门裂、肛周皮肤皲裂等疾病中较多见。病人要根据病因来治疗。此外有一种肛门疼痛、坠胀和妇科、泌尿、男科或盆腔疾病有关。这时需明确诊断后才能治疗。