早上起床眼睛充血比较严重，考虑是病人结膜受到了病原微生物的感染而造成的结膜炎的症状。首先不要配戴隐形眼镜，更不要戴着隐形眼镜睡觉，会加重眼睛角膜和结膜的损伤。其次根据致病病原微生物来进行药物治疗，如果眼睛充血发红，分泌物增多，呈黄白黏脓性，考虑是细菌感染可能性比较大，治疗上可以使用左氧氟沙星眼药水来进行抗炎治疗。如果早上起来眼屎呈稀薄伴随眼睛发红等表现，这时需要考虑是病毒感染，进行更昔洛韦眼用凝胶来进行治疗。