肛门里面疼痛的原因有很多，但是在临床上主要有以下几种可能。第一，肛窦炎，因为肛窦的部位就在齿状线，而齿状线则是肛管和直肠的分界线，因此说肛窦炎造成的疼痛是典型的肛门里面疼痛，当然除了疼痛之外，还有瘙痒。第二，肛裂，特别是对于肛裂创面靠近齿状线的时候，在大便比较干结，排便比较困难时，造成的疼痛多数为肛门里面疼痛，当然除了疼痛之外，还会有便血。第三，肛管直肠恶性肿瘤，比如说直肠癌，有时候也会造成肛门里面疼痛，而且多数是下坠疼痛。当然除了下坠疼痛之外，还有一些排便习惯的改变等等。