先天性白内障的病因分为三个方面，第一个方面是遗传因素，大约有1/2的先天性白内障和遗传有关，一般是常染色体显性遗传。第二个方面是环境因素，主要有三种情况，母亲在怀孕的前三个月感染病毒，尤其是风疹病毒或盆腔受放射线照射，母亲有系统性的全身疾病以及母亲有全身的营养不良，早产儿、胎儿宫内缺氧也可以造成先天性白内障。第三个方面是不明确的原因，既找不到遗传的因素，也找不到环境的因素。