益生菌在医学上运用十分普遍，可以治疗腹泻、便秘、消化不良等表现。临床医学常用的益生菌有双歧杆菌、布拉氏酵母菌、乳酸菌等。对于大部分人来说是吃益生菌是有益的，可以维持人体倡导的菌群平衡，因此促进消化。益生菌拉肚子的原因可能如下：1、病人体内有很多有害菌，有益菌进入体内后会和有害菌竞争导致腹泻。2、就是医学上常说的赫氏消芒现象，因为病人刚开始服用体内体内菌菌较少，突然增加的菌群会让机体来不及反应，进而导致这一现象。一般这种情况过几天也就会消失，如果过几天仍然表现出腹泻，尽量不要再使用这种益生菌，可以改用其他的来替代。在饮食上注意饮食结构，少吃辛辣刺激的食物，多吃易消化、新鲜的食物。