绝大部分霉菌性阴道炎都是属于内源性的感染，就是指阴道菌群环境失调后阴道内的霉菌大量滋生造成。只有少部分女性才可能是由于性生活时男性将霉菌直接传染到女性阴道内而造成的感染。造成内源性感染最主要的诱因，可能是由于女性长时间服用广谱抗生素或者是抗结核药物以及各种免疫抑制剂，造成阴道菌群环境失调后表现出的霉菌性阴道炎，还可能是由于女性是在怀孕期间卵巢分泌的雌孕激素比较高，因此也会间接造成阴道菌群环境失调，而表现出霉菌性阴道炎。