睡醒后一只眼睛疼有很多种可能：一、视疲劳，很多人由于长期使用手机、电脑，长期近距离用眼造成。一般注意休息，这种疼痛可缓解。一般双眼多见，偶尔见于单眼。二、屈光不正，有些人因为戴了不合适的眼镜，造成了眼球的疼痛，这需要到医院进行验光检查，重新配镜。三、眶上神经痛，当眶上神经受到刺激，有可能会造成眼球的疼痛。这也需要到医院进一步检查。四、眼部的感染，如果表现出了眼睑结膜、角膜、虹膜等眼部的感染后，会表现出周围组织的疼痛，需要给予相应的抗感染治疗。五、青光眼，这是要特别注意的，如果表现出眼睛疼痛，特别是胀痛，甚至合并有视力下降、恶心呕吐、头痛等，很可能是急性青光眼的表现，建议尽快就医。因此，无论如何表现出眼睛的疼痛，需要到眼科就诊。