三叉神经痛的病人可能病因不是很明确，因为有一些病人往往和机体免疫功能等因素有关，这些病人可能没有器质性的病变。还有一些病人可能是继发性因素造成的三叉神经痛，比如病人如果存在高血压、糖尿病、高脂血症等血管病的危险因素，就容易造成中枢神经系统表现出脑血管疾病。如果病人表现出了脑干的梗死、脑干出血或者脑干存在肿瘤或者脱髓鞘性的疾病，这些病人就容易表现出三叉神经痛。还有一些病人如果存在齿龈的感染或者颌面部存在肿瘤，或者进行了颌面部的手术治疗，这些病人也有可能会表现出三叉神经痛。