怀孕三个月如果表现出肚子明显疼痛，以小腹疼痛为主，并且像来月经一样呈现为痛经，这是属于异常的，和先兆流产密切相关，尤其是合并有腰酸腰胀，阴道出血者需要及时检查明确后保胎治疗。若是以脐周疼痛为主，和饮食有关系，或者还合并有便秘腹泻，恶心呕吐等表现，和胃肠道疾病密切相关，比如急性胃肠炎，或者是由于大便淤积造成。确诊后需要及时抑酸护胃药物有效改善，同时观察大便情况。