跖疣是一种生长在脚上的寻常疣，而寻常疣是人乳头瘤病毒感染造成的皮肤病，所以治疗上主要进行抗病毒治疗。主要进行局部治疗，常用冷冻治疗，就算用 -196℃的液氮，将局部的病毒冻死。冷冻治疗需反复多次，一直到完全去除病毒，治疗无不良反应，且不会影响病人日常生活。也可以采用激光治疗。此外，也可在医生的指导下外用氟尿嘧啶、干扰素凝胶、咪喹莫特软膏等抗病毒药膏，加强抗病毒疗效。