幽门螺旋杆菌的三联治疗方法主要是予单联的抗生素，同时结合抑制胃酸分泌药物以及保护胃黏膜药物三种药物联合治疗以有效的根除幽门螺旋杆菌。如果治疗有效，正常幽门螺旋杆菌可以转阴，经过碳13或碳14呼气试验，可以更具特异性及敏感性了解幽门螺旋杆菌转阴的情况。如果仍然有明显的不舒服的表现的，需要继续予治疗消化性溃疡药物有效地促进溃疡面愈合，避免造成病情反复发作，甚至可能会持续加重。