子宫内膜异位症，在临床上处理较为棘手，至今原因不明，有多种猜测，但都不能完全解释临床现象。现阶段比较多见的：在位内膜学说，即在某个部位，自身细胞化生出具有子宫内膜功能的细胞。考虑是经血逆流种植学说，即由于性生活、宫腔操作史或者其他情况造成的经血逆流，把子宫内膜带入盆腔种植在某个部位，造成子宫内膜异位症。部分认为和遗传因素和免疫因素有关。在临床上，由于原因不明，主要是对症处理。处理的原则，一般是去除病灶、缓解疼痛、促进生育、预防复发等方面。