阴茎上长小米粒状的疙瘩可能的原因：第一、皮脂腺异位症，表现于阴茎皮肤上略突起的小丘疹样的改变，没有疼痛、红肿，没有局部的分泌物等，可长时间存在不发生任何变化，一般不用任何处理。第二、阴茎的珍珠样丘疹，可以分布在龟头冠状沟及包皮系带两侧，为柔软的肉芽样突起，没有疼痛、分泌物，没有局部的异常气味等，也可长时间存在，体积、大小不发生变化。和包皮过长、包茎或者局部卫生不好等因素有关，不具备传染性，也可不用处理，对于存在有包皮过长、包茎的病人可以行包皮环切手术。第三、尖锐湿疣，它是性传播疾病，经过不洁的性接触而感染，可以表现出小米粒状的疙瘩，其后可以发生相互融合转化成乳头样或者菜花样的肿块，伴随疼痛、分泌物或者出血等，需要进行局部切除，确诊以后抗病毒治疗。