在怀孕三个月的时候有褐色的分泌物流出，这属于不正常的表现。在怀孕期间，有可能会表现出分泌物增多，但是分泌物应当是乳白色或者无色透明的，不应当是褐色的分泌物表现出，这种情况应当考虑是先兆流产。这种情况需要注意观察，看看有没有表现出肚子疼痛或者肚子下坠的感觉，如果表现出这些症状，应当及时的去医院检查，进行保胎治疗。如果没有这些症状，只是表现出有褐色分泌物，需要卧床休息，不要过于的紧张，然后注意观察分泌物的量是否减小。如果有劳累过度或者运动量过大的时候，或者在这期间有过性生活，有可能会表现出这种症状，在休息之后得到改善，不需要特殊的治疗。