如果肛门内部疼痛，首先可以前往肛肠科就诊，造成肛门内疼痛的原因有很多，有可能为直肠黏膜下脓肿，有时肛腺感染后沿着直肠向直肠方向蔓延，形成直肠黏膜下脓肿，表现为肛门直肠坠痛，排便时会使疼痛进一步加重，可以经过肛周彩超明确诊断，也可以行内镜下超声检查，明确脓肿的范围。有时肛管恶性肿瘤，随着病情的进一步发展，也会造成肛门内部疼痛，可以经过直肠指诊触及质硬包块，凹凸不平，有时还会破溃，有脓液，还可以行肠镜检查，还可以取病理组织学检查，判断恶性肿瘤的性质以及严重程度。