女士小便时尿道内刺痛，则可能的原因如下：1、急性尿道炎或者膀胱炎，可以表现出尿道内刺痛感，多因炎症导致局部黏膜表现出糜烂、充血、水肿等改变。故而会表现出排尿时刺痛感。2、尿道结石，可以表现出尿道黏膜局部损伤，排尿时可以表现出刺痛感，并且结石可以刺激黏膜产生持续的疼痛感，需要进行尿道镜检查。病人多有排尿困难或者排尿不畅的病史，还可能伴随尿道口出血。3、尿道发生了肿瘤、息肉等，导致尿道黏膜破坏，这是可以表现出尿道刺痛，排尿时加重，同时可伴随尿道口出血，或者伴随排尿不畅、尿道内有阻塞感等。需要进行尿道镜检查等，明确是否患有尿道肿瘤或者息肉等病变。如确诊存在，就得要进行尿道镜下局部活组织病检，病检结果回报后，要考虑手术切除。