阴茎部位不舒服，可能是以下几种因素所导致：1*前列腺炎，前列腺表现出炎症时，会引发尿不尽、尿频、尿等待等表现，进而影响到阴茎，使阴茎表现出疼痛和不舒服的感觉；在表现出这些症状后，病人应去医院做前列腺液的检查，来明确诊断。2*尿道感染，尿道感染会导致尿道内海绵体表现出灼热、疼痛、肿胀，使阴茎非常不舒服；病人可去医院进行尿液常规检查。3*如果尿道内有肿瘤或者结石，也会引发疼痛，疼痛会放射到龟头以及阴茎海绵体位置，使阴茎表现出不适感；可去医院进行尿道镜检查，来明确尿道内是否存在肿瘤或者结石。