由于纵隔子宫内膜成熟障碍伴随腺体开口减少、纤毛发育不完全、纤毛细胞比例降低，可造成分化不完全和覆盖在纵隔上的子宫内膜成熟障碍。这些发育和成熟障碍可影响子宫内膜的容受性、种植和早孕期进程，所以可能会发生不孕、习惯性流产、产科并发症较多等异常情况。