造成胃酸反流的主要原因是食管下段括约肌功能障碍，如贲门失弛缓症手术后、食管裂孔疝、腹内压增高如妊娠、肥胖、腹水、呕吐、负重劳动等，及长时间胃内压增高如胃扩张、胃排空延迟等，均可使食管下段括约肌结构受损；某些激素如缩胆囊素、胰高血糖素、血管活性肠肽等，某些食物如高脂肪、巧克力等，及某些药物如钙通道阻滞剂、地西伴等，均可使食管下段括约肌功能障碍或一过性食管下段括约肌松弛延长。当食管的清除能力和黏膜屏障不足以抵抗反流物的损伤时，则可造成胃食管反流病。