月经不调理论上是可以同房的，因为月经不调一般是内分泌的原因，在临床上是不影响同房的，但是有些情况下由于排卵期的不稳定，可能会不能准确的计算安全期，需要积极采取避孕的措施，建议要采取使用避孕套的方式避孕。如果女性月经不调，一定要及时的去专业的医院进行诊断，有时月经不调是由于一些妇科疾病，会影响到女性的生育，因此应当配合医生进行及时的调理，有的时候需要进行性激素水平的测量，对甲状腺功能进行检测，然后再给予一定的处理。