巧克力囊肿属于子宫内膜异位症造成的，囊肿不大可以采用中医加西医治疗，有可能恢复的。但是如果囊肿较大就需要手术治疗后，再用中药或是西药治疗子宫内膜异位症。不过，单纯药物治愈可能性不大，到绝经后就会自行好转。如果有明显痛经还有可能发展成子宫腺肌症的，子宫腺肌症痛经特别明显，需要手术切除子宫后药物治疗。建议定期复查囊肿情况，增长明显就需要及早手术治疗。